Next-Generation-Sequencing Schnelle und effiziente Erstellung von NGS-Bibliotheken

Für die schnelle und effiziente Erstellung von NGS (Next-Generation-Sequencing)-Bibliotheken hat Merck Millipore die neuen Puregenome Kits und Reagenzien vorgestellt. Diese Reagenziensätze reduzieren die Erstellung von Bibliotheken auf zwei Schritte, die weniger als zwei Stunden in Anspruch nehmen.

Anbieter zum Thema

Deutsche METROHM GmbH & Co. KG

Shimadzu Deutschland GmbH

Socorex Isba SA

Merck Millipore GmbH

Die Bibliothekerstellung mit dem Puregenome Kit ist ein einfacher zweistufiger Prozess mit nachfolgender Amplifikation mit dem Ultra-HiFi KOD Hot Start DNA-Polymerase-Mastermix von Merck Millipore. Diese Polymerase amplifiziert DNA mit hoher Prozessivität in sehr AT- oder GC-reichen Abschnitten, betont der Hersteller. Die Kombination aus effizienter Bibliothekskonstruktion und präziser Amplifikation erziele daher eine maximale Ausbeute mit weniger Ausgangs-DNA und minimalem GC-Bias.

Sequenzdaten von Bibliotheken, die mit den Puregenome NGS-Reagenzien erstellt wurden, sind von höchster Qualität hinsichtlich Phred-Score (Q20 > 85%) und einem höheren Match/Mismatch-Verhältnis. Bessere Sequenzdaten liefern letztendlich aussagekräftigere biologische Ergebnisse, insbesondere bei Anwendungen, die eine hohe Empfindlichkeit und Spezifität erfordern, wie z.B. Genexpressionsanalysen oder Studien zu Einzelnukleotid-Polymorphismen (SNP). Die NGS-Reagenzien wurden für Illumina-plattformkompatible NGS-Bibliotheken validiert, können jedoch auch für andere Plattformen optimiert werden.

Weitere Kits im Puregenome Workflow sind das Puregenome Gewebe-DNA-Extraktionskit, das spezifisch für die Erstellung von NGS-Bibliotheken aus festem Gewebe, biologischen Flüssigkeiten und Zellkulturen validiert wurde, sowie das Puregenome On-Spot Gewebe-DNA-Kit. Dieses dient der Extraktion von DNA aus gezielten Stellen von Gewebeschnitten und ermöglicht eine Analyse extrem kleiner Proben. Das Puregenome NGS-Bibliotheken-Validierungskit ermöglicht eine sehr präzise und kosteneffektive qPCR-Quantifizierung von NGS-Bibliotheken, die mit der Illumina-Plattform kompatibel sind.

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