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Next Generation Sequencing NGS-Arbeitsabläufe durch automatisiertes Liquid Handling optimieren

Quelle: Pressemitteilung Integra Biosciences AG 2 min Lesedauer

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Mit Liquid-Handling-Lösungen und magnetischen Modulen bietet Integra Biosciences die Toools, um die Probenvorbereitung fürs Next Generation-Sequencing zu optimieren. Die Geräte sollen Fehler reduzieren und die Präzision von Sequenzierungsdaten verbessern.

Das Workflow-Diagramm zeigt, wie die Liquid-Handling-Lösungen von Integra jeden Schritt der NGS-Vorbereitung rationalisieren und die Effizienz der NGS-Bibliotheksvorbereitung optimieren können.(Bild:  Integra Biosciences)
Das Workflow-Diagramm zeigt, wie die Liquid-Handling-Lösungen von Integra jeden Schritt der NGS-Vorbereitung rationalisieren und die Effizienz der NGS-Bibliotheksvorbereitung optimieren können.
(Bild: Integra Biosciences)

Integra Biosciences bietet Lösungen für das Liquid-Handling und magnetische Module für jede Phase der Probenvorbereitung beim Next Generation Sequencing (NGS). Diese Geräte sollen laut Hersteller dazu beitragen, Fehler zu reduzieren, die Präzision und Zuverlässigkeit von Sequenzierungsdaten zu verbessern und Prozesse zu beschleunigen.

NGS ist eine Technik mit hohem Durchsatz, mit der sich große Mengen an DNA oder RNA sequenzieren lassen. Dies ermöglicht eine Analyse des genetischen Materials für Anwendungen wie Genomik, Transkriptomik und personalisierte Medizin. Der NGS-Arbeitsablauf umfasst die Probenvorbereitung, die Bibliotheksvorbereitung, die Qualitätskontrolle und die Sequenzierung. Alle Schritte erfordern eine genaue Handhabung der Flüssigkeiten, um Konsistenz und Reproduzierbarkeit zu gewährleisten. Die manuelle Probenhandhabung kann zeitaufwendig sein und ist fehleranfällig.

Pipettierlösungen für alle NGS-Phasen

Die Pipettierlösungen von Integra können in jeder Phase des NGS-Arbeitsablaufs eingesetzt werden, um die Handhabung von Flüssigkeiten zu beschleunigen und menschliche Fehler zu reduzieren. So lässt sich z. B. der Assist-Plus-Pipettierroboter mit den Voyager-Pipetten mit einstellbarem Spitzenabstand kombinieren, um eine Reformatierung der Proben von Röhrchen auf Platten zu ermöglichen. Diese Automatisierungslösung kann – zusammen mit den elektronischen Handpipetten Viaflo 96 und Viaflo 384 – auch mit den Modulen Mag oder Heatmag von Integra für halb- oder vollautomatische Nukleinsäure-Extraktionen mit magnetischen Beads genutzt werden.

Vollautomatisierte Bibliotheksvorbereitung

Im anschließenden Schritt der NGS- Bibliotheksvorbereitung eignet sich die Mikrofluidik-Plattform Miro Canvas von Integra für die enzymatische Fragmentierung, die PCR-Schritte und das Aufreinigen mit magnetischen Beads, sodass die Proben in einem einzigen Durchgang sequenziert werden können. Dieses automatisierte Protokoll zur NGS-Bibliotheksvorbereitung soll die Genauigkeit erhöhen und menschliche Fehler minimieren.

Alternativ können Labore den Assist-Plus-Pipettierroboter oder die Viaflo 96- und Viaflo 384-Pipetten mit den Mag- oder Heatmag-Modulen kombinieren, um die Aufreinigung mit Beads und die Größenselektion im NGS-Arbeitsablauf zu optimieren. Der Assist Plus kann auch mit dem Einkanal- Pipettiermodul D-One gekoppelt werden, um die Normalisierungs- und Pooling-Schritte vor dem Start des Sequenzierungslaufs zu automatisieren.

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