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DNA-Extraktionskits für die Mikrobiom-Forschung Effizientere Erforschung von Darmgesundheit, Bodenmikrobiologie und mehr

Quelle: Pressemitteilung 2 min Lesedauer

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QIAGEN GmbH
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JULABO GmbH
INTEGRA Biosciences AG

Für eine effizientere Mikrobiom-Forschung hat Qiagen neue Seq-Sets eingeführt, die laut Unternehmensangaben moderne Extraktionstechnologie mit einfach zu handhabender, nachgeschalteter Vorbereitung von NGS-Bibliotheken verbinden.

Die Gemeinschaft verschiedener Mikroben im Darm, das so genannte Darmmikrobiom, ist zentral für die Gesundheit des Menschen und daher Gegenstand intensiver Forschung.(Bild: © Tatiana Shepeleva - stock.adobe.com)
Die Gemeinschaft verschiedener Mikroben im Darm, das so genannte Darmmikrobiom, ist zentral für die Gesundheit des Menschen und daher Gegenstand intensiver Forschung.
(Bild: © Tatiana Shepeleva - stock.adobe.com)

Die Mikrobiom-Forschung hat in den vergangenen Jahren erheblich an Bedeutung gewonnen. Sie untersucht die Beziehungen zwischen Mikroorganismen wie Bakterien, Pilzen und Viren und dem jeweiligen Wirt. Ziel ist, ihre Auswirkungen auf die Gesundheit, Krankheiten und ökologische Prozesse besser zu verstehen, um neue Diagnose- und Therapiestrategien entwickeln zu können.

Im November hat der Molekulardiagnostik-Anbieter Qiagen seine neuen Microbiome WGS Seq-Sets eingeführt. Der umfassende „Sample to Insight“-Workflow ist einfach anzuwenden und erhöht die Effizienz und Reproduzierbarkeit in der Mikrobiom-Forschung, heißt es vom Hersteller in einer Pressemeldung. „Unsere Microbiome WGS Seq-Sets verbinden unsere branchenführende Extraktionstechnologie mit einfach zu handhabender, nachgeschalteter Vorbereitung von NGS-Bibliotheken und intuitiver Bioinformatik. Damit sind sie eine vollständige ‚Sample to Insight‘-Lösung“, sagt Nitin Sood, Senior Vice President und Leiter des Geschäftsbereichs Life Sciences bei Qiagen. Der verbesserte Workflow helfe Forscher bei Herausforderungen wie Bias in der DNA-Extraktion, Komplexität der Bibliotheksvorbereitung und fehlender Expertise in der Bioinformatik.

Die Seq-Sets wurden für die Mikrobiom-Forschung entwickelt, darunter Studien zu Darmgesundheit, Bodenmikrobiologie und Antibiotikaresistenz. Der Workflow beginnt mit der DNA-Extraktion mit dem DN-Easy Power-Soil Pro Kit oder dem Qia-Amp Power Fecal Pro DNA Kit. Beide isolieren effizient hohe Mengen an DNA und erkennen eine größere bakterielle Diversität als andere kommerzielle Kits, heißt es vom Hersteller.

Nach der Extraktion erleichtert das Qia-Seq Normalizer Kit die Bibliotheksnorma­lisierung und ermöglicht ein einfaches Pool­ing für eine Sequenzierung mit hohem Durchsatz. Das Qia-Seq FX DNA Library Kit sorgt für eine schnelle Vorbereitung von NGS-Bibliotheken für eine Metagenomanalyse in nur 2,5 Stunden. Dabei werden Sequenzierungsbibliotheken mit minimalem Bias durch enzymatische Fragmentierung und Adapter-Ligation erstellt.

Zuletzt erfolgt eine Bioinformatikanalyse über das Microbial Analysis Portal, eine webbasierte Plattform. Es ermöglicht die taxonomische Erkennung von Mikroben, schlüsselt mikrobielle Spezies detailliert auf und unterstützt die Analyse von antimikrobiellen Resistenzen (AMR) zur Erkennung von Antibiotika-Resistenzgenen.

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