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Sequenzdatenbank Konsortium setzt neuen Standard für Sequenzdatenbanken

Redakteur: Olaf Spörkel

Ein internationales Wissenschaftler-Konsortium hat eine neue Richtlinie für die Veröffentlichung von Genomsequenzierungsdaten publiziert. Die Empfehlungen enthalten Angaben über Mindestinformationen und Kriterien zur Qualität der Daten.

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Bremen – In Sequenzdatenbanken wie GenBank und EMBL sind inzwischen die kompletten Genome von mehr als 1000 Einzellern und 100 Eukaryoten gespeichert und öffentlich zugänglich. Ein internationales Wissenschafterteam hat jetzt neue Regeln publiziert, welchen Qualitätskriterien die Datensätze genügen sollten und welche Mindestinformationen anzugeben seien. Die neue Richtlinie des Genomics Standard Consortiums (GSC) nennt sich „Minimum Information about a Genome Sequence“ (MIGS).

„Wir arbeiten jetzt seit mehr als sieben Jahren im Bereich der marinen Umweltgenomik. Die neuen Standards bringen uns einen Riesenschritt voran, indem sie uns helfen werden unsere Umweltorganismen besser verstehen zu lernen“, sagt Prof. Dr. Frank Oliver Glöckner vom Bremer Max-Planck-Institut für Marine Mikrobiologie als Beteiligter am Projekt.

Ähnlich wie bei der Entwicklung der Web-Standards soll der MIGS-Standard den molekularen Informationsfluss in der Biologie erleichtern. Wie es in einer Pressemitteilung heißt, hat das Konsortium mit den Betreibern der öffentlichen Sequenzdatenbanken die Genominformationen so standardisiert, dass diese auch mit zukünftigen Anwendungen kompatibel sind. Mit einem Internetbrowser hat jeder Zugang zu den derzeit verfügbaren Informationen der Genome auf der Website.

Originalveröffentlichung : Dawn Field et al.: The Minimum Information about a Genome Sequence, Nature Biotechnology. 2008; 26, 541 - 547.

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