Proteinfabrik Ribosom Molekularer Schalter für Transfer-RNA-Transport entdeckt

Innsbrucker Wissenschaftler finden molekularen Schalter für einen der grundlegendsten Mechanismen des Lebens – der Proteinherstellung in den Ribosomen.

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Innsbruck, Österreich – Die Innsbrucker Wissenschaftler Norbert Polacek vom Biozentrum der Medizinischen Universität (Sektion für Genomik und RNomik) und Ronald Micura von der Leopold-Franzens-Universität haben in den letzten Jahren entscheidend dazu beigetragen, den molekularen Mechanismus der Proteinherstellung in den Ribosomen aufzuklären. In ihrer kürzlich online erschienenen Arbeit, die von Nina Clementi aus Polaceks Gruppe federführend durchgeführt wurde, untersuchen sie das „Förderband“ der Ribosom-Maschinerie: es geht um den Transport der Transfer-RNAs (tRNAs). Die Arbeit fand im Rahmen des GENAU-Projekts zu nichtkodierenden RNAs statt, das von der Innsbrucker Firma CEMIT gemanagt wird und wurde auch vom Wissenschaftsfonds FWF gefördert.

Neues Verfahren der Atomaren Mutagenese

tRNAs sind die Träger der Aminosäuren, die im Ribosom zum Peptid verknüpft werden. Wenn sie ihre „Fracht“ abgeliefert haben, machen sie rasch Platz für die nächsten, mit neuen Aminosäuren beladenen tRNAs. Damit das Weiterrutschen der tRNAs reibungslos funktioniert, muss eine chemische Reaktion am Ribosom stattfinden: die Hydrolyse des Energieträgers GTP an dem Enzym EF-G (elongation factor – G). Es lag nahe, dass das Ribosom selbst über einen „Schalter“ verfügt, der diese Reaktion auslöst. Doch wo dieser Schalter sitzt, war unklar.

Um dies herauszufinden, wandten die Innsbrucker Wissenschaftler das von Polacek und Micura entwickelte Verfahren der atomaren Mutagenese an. Der Molekularbiologe Polacek schneidet kleine Stücke der ribosomalen RNA gezielt heraus, und der organische Chemiker Micura stellt die passenden Ersatzteile her: künstliche Stücke ribosomaler RNA, die nur in einzelnen Atomen vom natürlichen Vorbild abweichen. Anschließend testen die Wissenschaftler, wie sich der Austausch einzelner Atome oder Atomgruppen auswirkt – in diesem Fall auf die Fähigkeit des Ribosoms, die Hydrolyse von GTP – EF-G auszulösen.

Molekularer „Schalter“ aufgeklärt

Mit diesem Verfahren wurden Nina Clementi und andere Mitarbeiter fündig: Der „Schalter“, mit dem das Ribosom die Hydrolyse auslöst, ist eine Aminogruppe der Nukleotidbase Adenin 2660. Die Autoren vermuten, dass eine bestimmte Art der chemischen Wechselwirkung zwischen der Nukleotidbase und dem Enzym EF-G, das „Stapeln“ elektronenreicher Ringsysteme, für die entscheidende Konformationsänderung verantwortlich ist. Sie lässt den „Schalter“ umkippen und löst die Hydrolyse und in Folge den Weitertransport der tRNAs aus. Wie entscheidend diese Nukleotidbase ist, zeigt auch die Tatsache, dass Gifte wie das hochtoxische Rizin in unmittelbarer Nähe binden. Sie wirken, indem sie die Proteinherstellung blockieren.

Originalpublikation:

Clementi et al. „Atomic mutagenesis reveals A2660 of 23S ribosomal RNA as key to EF-G GTPase activation“, nature chemical biology, DOI: 10.1038/nchembio.341, online-Ausgabe vom 28.3.2010

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